擁有61年歷史的上海市中醫文獻館是上海唯一一個以中醫文獻研究為主要研究方向的機構，肩負著把傳統文獻融入中醫發展新時代潮流中的重任。
1956年建館之初，上海市中醫文獻館聘任62位名老中醫為館員，1981年又第二批聘任了32位當時的上海市名老中醫，最近一次則是在2013年，聘任了32位館員和3位名譽館員。多年來，張鏡人、裘沛然、顏德馨、石仰山、朱南孫等國醫大師及諸多上海知名專家云集于此。通過館員制的方式，名老中醫的學術經驗、成才之路和臨床優勢得以傳承、發展、創新。
在對館藏文獻的收集、整理和發掘過程中，上海市中醫文獻館還將具有重要歷史地位的海派中醫流派作為文獻研究的中心內容，并通過師承教育等方式，更好地為上海居民服務。

上海市中醫文獻館以科研為主，同時兼有教學和臨床任務。
中醫藥大學以及開設相關課程的學校，其主要任務是“教”——培養學生的臨床基礎，醫院的重點則放在“醫”——臨床的診療和服務上，上海市中醫文獻館則將這兩個功能相結合。
學術研究、文獻著作最終要變成老百姓實際的療效，對社會發展產生直接的作用，為此，上海市中醫文獻館設立中醫特色門診部，用臨床實踐的形式，來傳承和發揚上海海派中醫名家的學術經驗。
門診部只提供中藥飲片、針灸、推拿等傳統中醫服務，在上海公立醫療機構中極具特色。

近幾年，上海市中醫文獻館的發展進入了新時期。今年，在原有工作基礎上，文獻館提出開放辦館，其中，尤其注重中醫藥文化的傳播。在原有中醫文獻雜志社的基礎上，文獻館整合館內優質資源，新成立中醫藥文化傳播研究中心，探索中醫藥文化傳播路徑。
2017年9月中旬到11月中旬，海派中醫專列“現身”上海地鐵2號線、10號線，直接面向年輕人傳播中醫藥文化。與此同時，取材于館長本人親身經歷的海派中醫宣傳片《同舟共濟》在網絡上引發熱烈反響。
上海市中醫文獻館正在朝著“讓年輕人了解中醫、喜愛中醫、使用中醫、信任中醫”的重要工作目標一步步邁進。

傳承、發展、創新是中醫藥事業永恒的話題。
首先是要在浩如煙海的中醫文獻中，把中醫藥的精華凝練出來，特別是基于上海本地的海派中醫特色。
其次是要和上海的社會經濟發展相適應，將傳統中醫藥和上海的創新發展結合好。上海市中醫文獻館把中小學生的中醫藥文化傳播作為下階段工作的重點，將選擇孩子們喜聞樂見的方式，讓他們成為中醫的粉絲，進而去影響他們的家庭。
再者，文獻館計劃和部分文化名人開展交流，探討在上海傳播中醫藥文化的有效路徑。
此外，文獻館還將進一步深入社區、發掘社區居民，分享中醫養生保健知識與方法，帶動社會對中醫的認可。